近期，總局貨勞司以司便函的方式答復了總局網絡安全和信息化辦公室兩個十分棘手的問題：一是關于差額開票的納稅申報問題；二是關于已繳納營業稅補開增值稅發票的納稅申報問題。
一、關于差額開票的納稅申報問題
問題背景
《國家稅務總局關于全面推開營業稅改征增值稅試點有關稅收征收管理事項的公告》（國家稅務總局公告2016年第23號）第四條第二款規定：按照現行政策規定適用差額征稅辦法繳納增值稅，且不得全額開具增值稅發票的（財政部、稅務總局另有規定的除外），納稅人自行開具或者稅務機關代開增值稅發票時，通過新系統中差額征稅開票功能，錄入含稅銷售額（或含稅評估額）和扣除額，系統自動計算稅額和不含稅金額，備注欄自動打印“差額征稅”字樣，發票開具不應與其他應稅行為混開。
問題描述
例如，一般納稅人提供勞務派遣服務適用差額征稅，含稅銷售額100萬元，向用工單位收取用于支付給勞務派遣員工工資、福利和為其辦理社會保險及住房公積金的費用80萬元，征收率5%。
繳納增值稅=（1000000-800000）/（1+5%）5%=9523.81元
金額=1000000-9523.81=990476.19元
并開具如下發票：
在填報《附列資料（一）時》，會出現兩種情況（詳見附件），而且在申報時因為差額征稅開票的不含稅金額和稅額之間沒有勾稽關系，造成票表比對不符。
建議
方案1.一窗式比對開票金額合計數和稅額合計數；
方案2.通過系統自動篩選差額開票出的納稅人，設為白名單，限定白名單有效期起止。
業務組建議，采用方案2。
請貴司明確
1.差額征稅的開票收入在填報《增值稅納稅申報表附列資料（一）（本期銷售情況明細）》銷售額和應納稅額欄次時，按照方式1還是方式2（見附件）填寫，如果上述填寫方式都不正確，請明確正確的填寫要求；
2.如填寫的不含稅金額與稅額之間沒有勾稽關系而導致票表比對不符的，采納問題描述中的哪種方案；如果上述方案都不采納，請明確如何解決。
貨勞司答
問題1：使用差額征稅開票功能的開票收入在填報《增值稅納稅申報表附列資料（一）》（本期銷售情況明細）銷售額和銷項（應納稅額）欄次時，按照方式1填寫。
問題2：由于使用差額開票功能，使得不含稅金額和稅額之間沒有勾稽關系，造成票表比對不符。針對此類情況，建議采用方案二解決。
貨勞司的答復言簡意賅，大家看懂了嗎？
嗯，讓我梳理下，大概是表達了以下這么幾層意思：
1、對于勞務派遣服務允許用新系統差額開具增值稅發票；
2、對于差額開票的應稅項目，在填寫納稅申報附列資料（一）時，仍應照適用稅率（征收率）換算成不含稅金額和銷項稅額（應納稅額）進行填列；
3、對于差額開票產生“票表比對”不符的情況，總局后續將通過系統進行自動篩選識別，列為“白名單”。
二、關于已申報營業稅補開發票問題
問題背景
《國家稅務總局關于全面推開營業稅改征增值稅試點有關稅收征收管理事項的公告》（國家稅務總局公告2016年第23號）第三條第七項第二款規定：納稅人在地稅機關已申報營業稅未開具發票，2016年5月1日以后需要補開發票的，可于2016年12月31日前開具增值稅普通發票（稅務總局另有規定的除外）。
問題描述
納稅人已申報繳納營業稅，營改增后開具了增值稅發票，在進行增值稅申報時，銷售收入不包含此類收入（已申報營業稅部分），目前稅控系統不能區分已繳營業稅開具的發票，傳遞給核心征管系統的發票數據包含此類發票，導致納稅人申報比對不能通過，只能按照異常進行處理，增加了前臺的工作壓力。
建議防偽稅控系統在開票界面，增加“已繳營業稅開具發票”的選項，以滿足后續業務不同工作的需要。
請貴司明確
1、在防偽稅控系統開票界面，增加“已繳營業稅開具發票”選項，是否可行；
2、如不采用上述方式，請明確票表比對的調整規則。
貨勞司答
問題1：對于納稅人已申報營業稅補開增值稅發票情形，我司正在研究增值稅發票管理新系統中增加補開增值稅普通發票功能。
問題2：對于已申報營業稅補開增值稅發票造成的票表比對不符，建議先接收納稅人的申報數據，記錄異常比對結果，作為事后核查事項。在接受事后申報事項的同時，可以對納稅人稅控設備清零解鎖。
貨勞司的這個回答比較清晰，你覺得呢？
對！我也有同感，那我也不再啰嗦了，但還是要提醒一句：
廣大納稅人朋友，為實現稅制轉換平穩過渡，雖然政策中明確了“納稅人在地稅機關已申報營業稅未開具發票，2016年5月1日以后需要補開發票的，可于2016年12月31日前開具增值稅普通發票”，但不代表大家可以濫用這個政策，您所開具的每一張發票都應當以真實申報為前提，否則將可能帶來后續的稅務風險。這些發票也都有可能成為將來的“呈堂證供”噢！